134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0981 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 290 aa  603  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  81.72 
 
 		 296 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  56.77 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  56.39 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  55.26 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  51.7 
 
 		 310 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  54.51 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  51.65 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  51.62 
 
 		 281 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  48.23 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  47.4 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  45.26 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  44.91 
 
 		 297 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  43 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  43.21 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  42.39 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  42.39 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  42.39 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  42.39 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  42.03 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  42.03 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  38.77 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  40.94 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  40.3 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  38.63 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  39.22 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  40.79 
 
 		 310 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  38.6 
 
 		 285 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  37.41 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  37.41 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  37.32 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  41.11 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  38.66 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  37.54 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  40.74 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  39.19 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  37.63 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  35.59 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  37.27 
 
 		 285 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  36.5 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  37.45 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  38.04 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  35.93 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  35.96 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  37.41 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  37.18 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  37.4 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  36.26 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  36.36 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  37 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  35.53 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  34.43 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  38.17 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  36.67 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  34.43 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  34.39 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  35.36 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  36.69 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  28.16 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  29.06 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  30.42 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  28.52 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  31.34 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  31.95 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  29.2 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  31.12 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  30.36 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  28.91 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  28.37 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  29.79 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  28.79 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  29.27 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  28.18 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  28.17 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  27.8 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  29.39 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  28.23 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  27.64 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  26.81 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  27.64 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  28.86 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  27.76 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  27.17 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>