140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5278 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  100 
 
 		 266 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  96.62 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  76.98 
 
 		 266 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  72.93 
 
 		 266 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  72.93 
 
 		 266 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  72.56 
 
 		 267 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  73.21 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  72.45 
 
 		 267 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  72.83 
 
 		 267 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  66.67 
 
 		 269 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  58.04 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  57.79 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  56.76 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  56.76 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  56.37 
 
 		 267 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  57.48 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  54.14 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  53.05 
 
 		 266 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  51.56 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  52.16 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  50.38 
 
 		 270 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  50.59 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  49.04 
 
 		 274 aa  255  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  49.04 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  49.43 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  48.85 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  48.85 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  48.85 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  48.85 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  48.85 
 
 		 285 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  48.29 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.08 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  48.85 
 
 		 344 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  48.66 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  47.86 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  48.06 
 
 		 265 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  46.95 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  50.57 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  47.64 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  45.69 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  48.44 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  48.44 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  47.66 
 
 		 265 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  47.15 
 
 		 271 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  47.66 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  47.66 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  47.64 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  48.81 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  46.3 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  45.63 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  44.15 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  46.44 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  46.44 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  43.61 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  45.67 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  44.49 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  46.01 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  44 
 
 		 266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  43.6 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  43.2 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  45.16 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  44.8 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  43.8 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  40.7 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  46.29 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  44.54 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  39.27 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  33.6 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  31.93 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  31.25 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  31.51 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  31.51 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  31.54 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  29.02 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  29.93 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  30.99 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  34.98 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  28.24 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  30.42 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  32.92 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  30.42 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 		 295 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  30.43 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  29.74 
 
 		 298 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  30.51 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 		 295 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  27.62 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  29.44 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  29.34 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>