140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4836 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  100 
 
 
266 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  96.62 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  77.36 
 
 
266 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  72.56 
 
 
266 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  72.18 
 
 
266 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  71.8 
 
 
267 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  73.96 
 
 
267 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  72.45 
 
 
267 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  73.58 
 
 
267 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  66.67 
 
 
269 aa  367  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  59.22 
 
 
267 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  58.69 
 
 
268 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  58.69 
 
 
268 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  58.3 
 
 
267 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  57.79 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  58.66 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  54.14 
 
 
267 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  53.05 
 
 
266 aa  271  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  51.56 
 
 
271 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  53.33 
 
 
273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  49.81 
 
 
274 aa  259  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  50.98 
 
 
291 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  50 
 
 
270 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  50.19 
 
 
274 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.46 
 
 
271 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  49.43 
 
 
288 aa  255  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 
344 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  49.04 
 
 
267 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  49.62 
 
 
274 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  48.29 
 
 
271 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  48.25 
 
 
270 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  50.95 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  46.95 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  47.29 
 
 
265 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  46.07 
 
 
274 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  48.05 
 
 
265 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  48.03 
 
 
270 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  46.85 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  48.05 
 
 
265 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.05 
 
 
265 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  48.05 
 
 
265 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  48.05 
 
 
265 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  49.21 
 
 
270 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  46.69 
 
 
265 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  46.77 
 
 
271 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  46.01 
 
 
271 aa  235  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  44.15 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  46.82 
 
 
271 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  46.44 
 
 
271 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  45.25 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  43.23 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  46.01 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  44.88 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  43.43 
 
 
266 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  43.2 
 
 
266 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 
277 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  43.8 
 
 
258 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  42.8 
 
 
266 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  44.76 
 
 
267 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  44 
 
 
273 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  45.25 
 
 
267 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  43.02 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  47.16 
 
 
267 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 
268 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  40.36 
 
 
284 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  34.31 
 
 
293 aa  112  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  32.39 
 
 
296 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  31.51 
 
 
314 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  35.22 
 
 
296 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  32.78 
 
 
297 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  29.56 
 
 
293 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  30.67 
 
 
298 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 
293 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 
298 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 
285 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  31.25 
 
 
286 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  31.25 
 
 
286 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  31.67 
 
 
296 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  31.67 
 
 
296 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  31.35 
 
 
321 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  30.53 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  29.74 
 
 
298 aa  99  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  28.75 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.5 
 
 
287 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 
298 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 
310 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  27.2 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 
295 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  27.11 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  30.47 
 
 
312 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  30.47 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  26.78 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>