138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4357 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 295 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  87.12 
 
 		 295 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  86.78 
 
 		 295 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  82.37 
 
 		 295 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  78.64 
 
 		 294 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  74.58 
 
 		 295 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  75.25 
 
 		 295 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  58.74 
 
 		 295 aa  348  9e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  57.39 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  55.67 
 
 		 296 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  56.6 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  57.82 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  57.82 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  56.67 
 
 		 321 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  56.06 
 
 		 300 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  51.99 
 
 		 312 aa  316  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  56.13 
 
 		 293 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  51.39 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  51.3 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  51.3 
 
 		 293 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  49.47 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  48.94 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  50 
 
 		 296 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  49.64 
 
 		 296 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  50.52 
 
 		 340 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  47.5 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  44.84 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  43.51 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  45.05 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  42.46 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  44.71 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  41.67 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  40.35 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  40.35 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  40.35 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  38.13 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  37.31 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  34.63 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  36.26 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  35.82 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  38.75 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  36.43 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  39 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  35.69 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  35.04 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  37.08 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  34.14 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  34.07 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  33.45 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  32.88 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  37.2 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  32.53 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  34.77 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  34.77 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  34.69 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  34.69 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  34.69 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  34.69 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  29.82 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  31.62 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  30.98 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  31.65 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  31.28 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  31.85 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  31.65 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  31.65 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  31.45 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  29.74 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  29.66 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  32.2 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  30 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  31.78 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  29.37 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  32.13 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  31.36 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  29.05 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  28.33 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  31.22 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  29.45 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 		 266 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  30.93 
 
 		 266 aa  92.4  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  30.96 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  27.97 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  27.39 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  27.82 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  30.68 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  25.94 
 
 		 267 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  30.17 
 
 		 287 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  30.99 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  25.94 
 
 		 267 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  25.28 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  26.36 
 
 		 267 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  30.42 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  26.64 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>