138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3744 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  69.59 
 
 
293 aa  427  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  69.26 
 
 
293 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  68.84 
 
 
293 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  58.67 
 
 
296 aa  332  5e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  58.67 
 
 
296 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  57.51 
 
 
296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  58.45 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  59.42 
 
 
296 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  57.91 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  58.74 
 
 
298 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  57.75 
 
 
298 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  57.75 
 
 
298 aa  316  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  57.45 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  54.51 
 
 
294 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  55.6 
 
 
295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  52.84 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  54.55 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  54.05 
 
 
295 aa  299  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  53.9 
 
 
295 aa  299  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  51.39 
 
 
295 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  51.29 
 
 
295 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  53.53 
 
 
300 aa  289  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  50.36 
 
 
295 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  51.8 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  51.93 
 
 
297 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  49.28 
 
 
310 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  49.64 
 
 
293 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  44.17 
 
 
286 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  46.04 
 
 
314 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  45.98 
 
 
319 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  41.3 
 
 
287 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  40.61 
 
 
286 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  40.27 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  45.29 
 
 
285 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  41.32 
 
 
287 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  42.44 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  40.21 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  38.32 
 
 
296 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  38.87 
 
 
286 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  38.81 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  36.5 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  40.96 
 
 
312 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  37.37 
 
 
302 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  39.64 
 
 
289 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  39.02 
 
 
281 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  37.37 
 
 
302 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  37.37 
 
 
302 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  37.02 
 
 
302 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  37.02 
 
 
302 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  37.82 
 
 
297 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  37.02 
 
 
302 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 
284 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  38.78 
 
 
281 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  40.16 
 
 
312 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  39.75 
 
 
310 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  37.45 
 
 
297 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  35.84 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  38.52 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  34.06 
 
 
285 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  36.84 
 
 
301 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  35.74 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  35.41 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  31.15 
 
 
258 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  29.92 
 
 
266 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  32.92 
 
 
270 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 
266 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  30.36 
 
 
274 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 
273 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  32.2 
 
 
270 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  28.99 
 
 
270 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 
266 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  29.26 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  30.28 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  29.74 
 
 
266 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  29.74 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  28.68 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  29.41 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.11 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  30.83 
 
 
274 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  30.83 
 
 
277 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  30.33 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  29.22 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  29.22 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  29.1 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  29.22 
 
 
265 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  29.22 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  27.14 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  28.75 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  28.51 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  28.81 
 
 
265 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  27.64 
 
 
268 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  28.29 
 
 
270 aa  89  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 
267 aa  89  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  28.35 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  27.07 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>