138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5957 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 268 aa  553  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  75.47 
 
 		 266 aa  430  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  76.72 
 
 		 273 aa  427  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  75.29 
 
 		 266 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  74.91 
 
 		 267 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  74.05 
 
 		 266 aa  411  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  74.81 
 
 		 266 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  71.05 
 
 		 271 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  66.79 
 
 		 263 aa  359  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  62.8 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  47.66 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  48.28 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  45.14 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  45.7 
 
 		 287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  45.28 
 
 		 273 aa  234  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  44.94 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  43.97 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  48.66 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  47.1 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  45.45 
 
 		 270 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  43.13 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  44.94 
 
 		 274 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  50.87 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  42.64 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  43.33 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  45.56 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  45 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  41.92 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  42.05 
 
 		 271 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  41.89 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  41.22 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  41.57 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  49.35 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  40.62 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  40.94 
 
 		 265 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  40.84 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  42.44 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  41.63 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  41.63 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  40.55 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  41.47 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  40.16 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 		 344 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  42.64 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  39.45 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  40.7 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  39.92 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  37.07 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  41.7 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  41.3 
 
 		 267 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  39.06 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  40.55 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 		 271 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  40.49 
 
 		 267 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  37.08 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  39.41 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  35.38 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  35 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  35 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  30.47 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  31.85 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  31.54 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  32.64 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  31.65 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  27.76 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  27.76 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  27.35 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  29.49 
 
 		 295 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  29.39 
 
 		 295 aa  92  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  27.9 
 
 		 321 aa  92  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  27.64 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  30.21 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  27.64 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  29.1 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  27.64 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  28.86 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  30.52 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  27.53 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  29.52 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  27.76 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  25.18 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  27.35 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  28.15 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  26.97 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  26.5 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>