136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2547 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  56.32 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  53.74 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  51.06 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  55.47 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  51.42 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  50.72 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  52.63 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  51.42 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  51.39 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  51.01 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  52.57 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  51.82 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  52.21 
 
 		 298 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  49.28 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  52.81 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  48.18 
 
 		 295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  51.09 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  51.65 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  47.5 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  47.5 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  47.04 
 
 		 295 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  48.21 
 
 		 294 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  44.64 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  48.33 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  48.18 
 
 		 295 aa  252  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  49.45 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  48.33 
 
 		 293 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  53.54 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  48.11 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  44.09 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  43.73 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  47.28 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  43.88 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  41.09 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  43.37 
 
 		 286 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  46.24 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  45.86 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  43.54 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  42.03 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  40.79 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  39.31 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  40.37 
 
 		 292 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  44.26 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  41.3 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  41.3 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  41.06 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  41.74 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  38.04 
 
 		 286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  40.15 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  36.01 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  37.59 
 
 		 284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  34.77 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  35.48 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.48 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  35.42 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  35.42 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  35.42 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.42 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  34.32 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  31.18 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  30.55 
 
 		 270 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  31.3 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  31.92 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  32.41 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  31.47 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  30.43 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  30.68 
 
 		 267 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  32.68 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  31.25 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  30.61 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  32.54 
 
 		 267 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  29.64 
 
 		 271 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  30.04 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  31.41 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  31.8 
 
 		 266 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  31.44 
 
 		 258 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  32.01 
 
 		 269 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  31.87 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  29.12 
 
 		 285 aa  92.8  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  30.62 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  31.87 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  27.38 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  31.4 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  30.28 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  30.14 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  31.45 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  30.52 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  31.2 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  28.46 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  28.17 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  30.23 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>