137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4353 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  100 
 
 		 262 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  52.17 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  50.4 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  50.2 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  46.18 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  48.43 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  46.79 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  46.42 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  46.42 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  46.42 
 
 		 285 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  46.42 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  46.42 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  46.42 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  48.25 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  47.56 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  46.18 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  48.22 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  46.09 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  48.22 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.22 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  48.62 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  46.01 
 
 		 271 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  44.7 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  48.22 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  48.22 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  44.4 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  46.9 
 
 		 287 aa  244  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  45.21 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  46.72 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  45.7 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  44.15 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  44.15 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  43.23 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  44.49 
 
 		 266 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  44.49 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  44.76 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  42.64 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  41.89 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  44.11 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  40.54 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  42.26 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  44.23 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  44.35 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  46.05 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  41.86 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  40.75 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  43.02 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  42.8 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  43.67 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  42.21 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  41.06 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  41.44 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  41.44 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  39.53 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  37.93 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  42.02 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  41.38 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  38.7 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  38.7 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  37.74 
 
 		 273 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  37.84 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  36.19 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  37.31 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  37.07 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  37.35 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  32.37 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  28.94 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  28.04 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  31.51 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  29.88 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  29.88 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  27.31 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  28.69 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  29.37 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  29.91 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  29.27 
 
 		 321 aa  99.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  30.36 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  27.27 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  29.21 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  26.94 
 
 		 296 aa  95.5  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  30.24 
 
 		 297 aa  95.5  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  29.51 
 
 		 295 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  30.29 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  30.17 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  28.08 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  30.29 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  28.82 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  29.89 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  25.94 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  28.27 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  30.26 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  26.01 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  27.21 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>