148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2850 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 271 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  75.65 
 
 		 270 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  67.9 
 
 		 271 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  65.17 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  65.43 
 
 		 273 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  64.39 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  65.54 
 
 		 274 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  62.88 
 
 		 274 aa  341  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  59.26 
 
 		 270 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  58.52 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  60.23 
 
 		 265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  58.3 
 
 		 271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  60.46 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  60.08 
 
 		 265 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  59.7 
 
 		 265 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  59.7 
 
 		 265 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  57.36 
 
 		 267 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  57.36 
 
 		 267 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  57.36 
 
 		 267 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  57.36 
 
 		 267 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  57.36 
 
 		 267 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  57.36 
 
 		 344 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  57.36 
 
 		 285 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  56.98 
 
 		 288 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  58.94 
 
 		 265 aa  314  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  58.56 
 
 		 265 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  53.21 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  53.46 
 
 		 270 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  52.67 
 
 		 266 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  52.29 
 
 		 270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  52.67 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  53.67 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  52.63 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  50.78 
 
 		 266 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  49.22 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  50.95 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  52.36 
 
 		 269 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  51.02 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  48.83 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  50.41 
 
 		 267 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  48.29 
 
 		 266 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  48.29 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  46.01 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  47.53 
 
 		 266 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  53.22 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  46.25 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  47.13 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  46.42 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  46.74 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  45.32 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  45.02 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  44.02 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  46.48 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  46.18 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  43.35 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  46.18 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  43.65 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  45.49 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  42.8 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  46.18 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  45.52 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  42.97 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  44.74 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  42.64 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  42.59 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  42.03 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  45.98 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  47.64 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  39.76 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  28.29 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  33.19 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  28.21 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  31.52 
 
 		 296 aa  85.9  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  27.11 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  27.73 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  27.73 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  29.48 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  30.13 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  28.03 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  32.43 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  29.66 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  30.28 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  31.09 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  29.2 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  29.18 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  29.2 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  29.24 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  27 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  28.06 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  30.56 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>