132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1317 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1317  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0639  N-formylglutamate amidohydrolase  46.97 
 
 
279 aa  236  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  33.83 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  27.4 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  30.33 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  28.46 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  28.22 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  30.87 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  30.61 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  29.46 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  29.15 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  28.06 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  31.47 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  28.41 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  27.27 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.03 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3287  glutamine synthetase catalytic region  27.24 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  26.57 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  28.29 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  28.1 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  28.22 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  31.03 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  27.17 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  27.7 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  29.02 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  27.46 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  26.83 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  26.83 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  26.83 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  29.09 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  27.31 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  27.31 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  26.83 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  26.83 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  26.83 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  26.25 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  26.95 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  27.18 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  26.55 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 
344 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  26.6 
 
 
298 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  29.27 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  28.11 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  28.91 
 
 
296 aa  62.4  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  25.83 
 
 
286 aa  62.4  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  26.83 
 
 
297 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  29.26 
 
 
265 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  29.91 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  26.47 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  29.56 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  28.86 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  25.88 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  26.18 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  27.31 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  29.27 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  28.4 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  28.46 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  27.76 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  26.32 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  28.52 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  25.42 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  26.15 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  26.79 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  28.46 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.46 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  25.21 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  27.76 
 
 
274 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  28.16 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  25.42 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  34.38 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  27.87 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  27.44 
 
 
296 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  25.39 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  25.73 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  27.78 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  25.62 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  25.1 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  25.09 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  26.45 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  28.05 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  25.27 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  25.86 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  25.89 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>