86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4642 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  61.57 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  58.74 
 
 		 240 aa  244  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  45.41 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  45.41 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  46.29 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  43.72 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  44.93 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  43.67 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  43.29 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  42.98 
 
 		 261 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  44.1 
 
 		 272 aa  164  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  43.91 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  41.78 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  40.89 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  42.36 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  41.1 
 
 		 279 aa  151  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  42.08 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  41.18 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  45.02 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  41.53 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  39.21 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  39.21 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  41.74 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  41.56 
 
 		 271 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  42.34 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  40.34 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  40.17 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  37.82 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  37.82 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  37.44 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  37.72 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  37.67 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  34.89 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  37.08 
 
 		 290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  37.02 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  36.48 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  38.26 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  38.26 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  36.73 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.78 
 
 		 239 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  34.58 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  35.86 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  37 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  34.98 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  34.62 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  34.62 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  34.67 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  35.32 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  34.8 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  34.76 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  35.56 
 
 		 272 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  33.91 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  31.7 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  31.25 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  30.32 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  27.31 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  27.69 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  31.54 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  31.54 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  29.1 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3287  glutamine synthetase catalytic region  27.54 
 
 		 276 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  32.23 
 
 		 293 aa  45.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  32.88 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  34.65 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  35.44 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  32.09 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 288 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  27.42 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 344 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  29.03 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  29.73 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  30.2 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  28.7 
 
 		 266 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  30.4 
 
 		 265 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>