88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1548 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
267 aa  544  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  62.03 
 
 
290 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  57.83 
 
 
265 aa  292  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  57.38 
 
 
267 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  59.75 
 
 
271 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  55.92 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  57.2 
 
 
261 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  55.24 
 
 
265 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  56.85 
 
 
266 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  57.49 
 
 
282 aa  268  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  52.63 
 
 
265 aa  255  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  48.99 
 
 
272 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  52.23 
 
 
260 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  49.19 
 
 
263 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  44.31 
 
 
271 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  46.18 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  46.86 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  44.4 
 
 
265 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  45.73 
 
 
250 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  44.4 
 
 
265 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  43.15 
 
 
255 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  41.77 
 
 
279 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  45.66 
 
 
222 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  39.83 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  44.07 
 
 
254 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.27 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  41.6 
 
 
272 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  42.26 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  42.26 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  38.89 
 
 
257 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  43.17 
 
 
257 aa  175  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  44.12 
 
 
250 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  36.95 
 
 
256 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  40.93 
 
 
272 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  40.25 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  41.63 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  40.83 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  40.42 
 
 
257 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  40.42 
 
 
257 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  38.15 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  42.08 
 
 
257 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  39.26 
 
 
269 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  37.14 
 
 
272 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 
276 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  40.83 
 
 
245 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  42.17 
 
 
245 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  42.61 
 
 
243 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  39.24 
 
 
264 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
243 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  35.89 
 
 
267 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
250 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  38.4 
 
 
274 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  42.36 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  39.42 
 
 
249 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  35.17 
 
 
266 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  42.8 
 
 
246 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  40.56 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  40.56 
 
 
245 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  33.51 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  34.87 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  25.44 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  24.85 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  28.86 
 
 
234 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  31.17 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 
266 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  28.39 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  30.14 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  25.87 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  35.11 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.17 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.86 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  32.19 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  30.83 
 
 
270 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  31.17 
 
 
274 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  28.91 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  27.39 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  27.56 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  35.35 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  26.34 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  34.69 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  25.17 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  29.68 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  24.9 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  35.37 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  25.59 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  25.9 
 
 
265 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>