71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3291 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  90.64 
 
 
269 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  70.21 
 
 
267 aa  353  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  71.06 
 
 
264 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  59.48 
 
 
272 aa  291  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  59.73 
 
 
272 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  59.48 
 
 
272 aa  277  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  58.19 
 
 
265 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  52.77 
 
 
279 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  51.57 
 
 
274 aa  232  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  54.19 
 
 
250 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  48.66 
 
 
257 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  48.66 
 
 
257 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  51.93 
 
 
250 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  48.47 
 
 
254 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  47.98 
 
 
257 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  46.98 
 
 
276 aa  201  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  48.89 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  49.32 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  44.49 
 
 
245 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  43.46 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  42.55 
 
 
265 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 
245 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  48.18 
 
 
246 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  39.22 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
267 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
272 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  39.74 
 
 
263 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  42.08 
 
 
236 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  39.42 
 
 
265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  39.42 
 
 
265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  39.82 
 
 
265 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  38.91 
 
 
249 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  41.23 
 
 
243 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  39.73 
 
 
266 aa  142  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  37.84 
 
 
264 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  38.33 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  38.5 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  38.46 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  38.46 
 
 
267 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  39.19 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  36.53 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  38.57 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  37.73 
 
 
282 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  35.68 
 
 
255 aa  121  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  34.42 
 
 
256 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  34.42 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  34.88 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  36.53 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  36.02 
 
 
279 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  35.58 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  35.58 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  35.65 
 
 
250 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  36.1 
 
 
222 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  33.77 
 
 
257 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.82 
 
 
239 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  32.17 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  29.31 
 
 
266 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  30.81 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  29.79 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  30.17 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  29.27 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  25.23 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  25.23 
 
 
247 aa  55.5  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  27.46 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  31.52 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  26.71 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  26.85 
 
 
268 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  26.85 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  26.85 
 
 
268 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>