67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6779 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  537  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  69.88 
 
 
290 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  70.08 
 
 
249 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  68.7 
 
 
265 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  68.15 
 
 
271 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  68.31 
 
 
266 aa  319  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  68.44 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  57.38 
 
 
267 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  56.79 
 
 
261 aa  265  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  50.94 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  51.95 
 
 
263 aa  255  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  52.26 
 
 
265 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  53.3 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  45.28 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  43.8 
 
 
271 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  45.87 
 
 
271 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  48.72 
 
 
237 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  41.87 
 
 
265 aa  191  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  41.87 
 
 
265 aa  191  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  44.44 
 
 
250 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  41.85 
 
 
239 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  45.66 
 
 
222 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  41.99 
 
 
256 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  43.02 
 
 
279 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  45.12 
 
 
250 aa  175  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  40.82 
 
 
257 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 
264 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  40.74 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  40.74 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  41.85 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  40.25 
 
 
257 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  39.83 
 
 
257 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  39.26 
 
 
279 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  41.07 
 
 
254 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  37.14 
 
 
255 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  39.43 
 
 
272 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  39.57 
 
 
265 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  39.57 
 
 
257 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  39.43 
 
 
272 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  39.64 
 
 
266 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  42.23 
 
 
250 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  38.52 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  38.79 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 
274 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  41.49 
 
 
249 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  41.28 
 
 
245 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  40.27 
 
 
245 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  39.82 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  38.46 
 
 
243 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  39.83 
 
 
264 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  34.89 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  40.17 
 
 
243 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  34.58 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  39.66 
 
 
245 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  39.66 
 
 
245 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  37.77 
 
 
246 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  35.86 
 
 
236 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 
240 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  34.23 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  32.08 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  32.23 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  24.23 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  23.79 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  28.19 
 
 
289 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  28.66 
 
 
287 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>