71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5770 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
263 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  51.95 
 
 
267 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  49.19 
 
 
267 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  51.22 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  51.76 
 
 
266 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  48.44 
 
 
265 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  49.17 
 
 
249 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  48.19 
 
 
261 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 
271 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  49.38 
 
 
260 aa  232  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  45.17 
 
 
272 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  47.06 
 
 
265 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  48.97 
 
 
265 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  49.79 
 
 
282 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  45.6 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  46.91 
 
 
250 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  42.11 
 
 
265 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  42.11 
 
 
265 aa  201  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  44.07 
 
 
257 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 
257 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  43.33 
 
 
279 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  41.28 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  45.27 
 
 
250 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  46.12 
 
 
222 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  40.54 
 
 
271 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  40.16 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  42.8 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  43.7 
 
 
279 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  41.53 
 
 
254 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  42.36 
 
 
237 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  39.06 
 
 
239 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  40.87 
 
 
276 aa  168  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  39.33 
 
 
269 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  38.98 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  38.3 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  37.92 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  39.24 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  39.65 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  39.37 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  42.08 
 
 
250 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  42.92 
 
 
257 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  38.87 
 
 
255 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  38.68 
 
 
265 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  39.24 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  39.74 
 
 
243 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  40.68 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  40.68 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  38.17 
 
 
264 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  37.18 
 
 
266 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  38.13 
 
 
249 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  40.89 
 
 
246 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  37.97 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  39.66 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  37.66 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  39.55 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  37.97 
 
 
245 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 
245 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  34.58 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  34.5 
 
 
240 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  31.48 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  31.67 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  26.47 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  25.47 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  24.77 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  29.82 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  27.54 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.33 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  25.1 
 
 
340 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  25.42 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  24.19 
 
 
296 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>