66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4543 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  58.72 
 
 		 279 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  58.3 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  58.3 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  52.38 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  50.21 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  51.27 
 
 		 256 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  48.73 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  49.78 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  45.38 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  45.38 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  44.35 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  42.45 
 
 		 264 aa  187  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  41.63 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  42.49 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  41.78 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  43.44 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  40.89 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  37.08 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  38.66 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  39.65 
 
 		 290 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  38.24 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  39.82 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  37.07 
 
 		 271 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  39.66 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  38.98 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  38.14 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  36.71 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  37.61 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  35.39 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  40.09 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  38.3 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  36.1 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  36.07 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  36.55 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  37.45 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  34.47 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  38.22 
 
 		 254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  35.22 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  35.22 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  32.89 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  32.44 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  33.48 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  37.04 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  32.08 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  32.17 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  32.92 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  32.37 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  33.87 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  35.37 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  32.76 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  31.6 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  32.79 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  31.69 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  32.59 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  32.9 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  23.53 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  29.95 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  22.13 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>