87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2056 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  64.85 
 
 		 250 aa  304  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  68.02 
 
 		 222 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  46.12 
 
 		 272 aa  204  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  46.15 
 
 		 266 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  45.54 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  44.2 
 
 		 290 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  39.83 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  44.34 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  41.85 
 
 		 267 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  42.55 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  43.58 
 
 		 282 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  43.36 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  40.17 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  39.06 
 
 		 263 aa  168  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  41.26 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  41.52 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  43.96 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  37.61 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  39.32 
 
 		 271 aa  161  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  39.29 
 
 		 260 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  39.41 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  38.36 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  39.41 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  40.18 
 
 		 257 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  40.54 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  40.54 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  39.73 
 
 		 266 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  38.72 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  41.78 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  37.39 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  37.71 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  38.33 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  36.68 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  36.51 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  36.51 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  35.81 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  33.78 
 
 		 236 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  33.78 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  34.93 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  33.93 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  34.5 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  34.5 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  30.64 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  32.07 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  35.53 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  34.38 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  32.13 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  35.09 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  33.19 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  33.82 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  34.07 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  34.96 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  34.96 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  32.04 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  30.37 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  28.96 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  28.96 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  28.95 
 
 		 289 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  28.28 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  26.92 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  24.86 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  26.28 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  25.16 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  26.88 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  26.56 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  27.04 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  27.93 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  25.75 
 
 		 340 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  28.81 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  25.26 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  26.47 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  24.63 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  25.42 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  29.32 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  26.19 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  27.66 
 
 		 265 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  25.44 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>