69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2032 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  49.64 
 
 		 272 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  50.57 
 
 		 267 aa  261  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  49.08 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  52.61 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  51.35 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  49.45 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  50.97 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  51.41 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  54.15 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  55.34 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  48.51 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  52.77 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  49.06 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  49.04 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  49.41 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  51.01 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  45.27 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  47.3 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  48.78 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  43.33 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  43.51 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  44.78 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  42.21 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  43.02 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  43.1 
 
 		 265 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  40.83 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  39.66 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  47.15 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  40.43 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  40.43 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  47.15 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  40.86 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  44.35 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.09 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  42.08 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  40.93 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  36.9 
 
 		 271 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  39.24 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  37.96 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  40.59 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  41.1 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  38.43 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  39.52 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  40.26 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  38.17 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  38.17 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  38.03 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  36.89 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  39.21 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  34.36 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  35.9 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  37.95 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  38.3 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  33.04 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  35.14 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  32.13 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  29.02 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  30.57 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  33.88 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  30.58 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  25.85 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  25.53 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  25.53 
 
 		 247 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  33.71 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  27.1 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  28.89 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>