97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2868 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  84.4 
 
 
266 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  70.88 
 
 
271 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  70.37 
 
 
290 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  68.44 
 
 
267 aa  338  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  68.02 
 
 
265 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  66.26 
 
 
249 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  57.49 
 
 
267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  54.37 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  53.33 
 
 
265 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  56.39 
 
 
260 aa  241  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  50.85 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  51.67 
 
 
265 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  48.7 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  44.66 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  39.84 
 
 
265 aa  191  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  39.84 
 
 
265 aa  191  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  44.08 
 
 
271 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  45.11 
 
 
237 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  43.58 
 
 
239 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  44.44 
 
 
250 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  38.33 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  43.11 
 
 
257 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  42.67 
 
 
257 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  39.83 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  41.98 
 
 
279 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  39.06 
 
 
255 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  39.62 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  39.57 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  43.12 
 
 
222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  43.1 
 
 
254 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  38.11 
 
 
257 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  42.92 
 
 
250 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 
245 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  37.6 
 
 
279 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  40.08 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  40.09 
 
 
265 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  40.08 
 
 
272 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  37.7 
 
 
264 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  39.57 
 
 
254 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  39.57 
 
 
254 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  37.04 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  41.88 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  38.46 
 
 
266 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  38.86 
 
 
257 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  36.73 
 
 
276 aa  142  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  37.12 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  39.58 
 
 
249 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  34.75 
 
 
274 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  39.32 
 
 
243 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  34.5 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  39.83 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  37.73 
 
 
243 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  39.83 
 
 
245 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  36.51 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  37.02 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 
240 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  36.21 
 
 
246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  34.18 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  31.61 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  33.55 
 
 
238 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.41 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  31.13 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  29.2 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.72 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  29.2 
 
 
271 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  32.26 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  27.11 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  23.65 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  26.21 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  23.65 
 
 
247 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.4 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  24.53 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  31.61 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  26.79 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  29.68 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  29.93 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  27.97 
 
 
265 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  27.61 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  30.91 
 
 
271 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  26.89 
 
 
285 aa  45.8  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  27.27 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  27.63 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  24.71 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  27.78 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  27.7 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  27.71 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  26.57 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  26.57 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  27.44 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  30.2 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  28.47 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  26.57 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  26.51 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>