95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1477 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  80.46 
 
 		 290 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  81.78 
 
 		 249 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  68.7 
 
 		 267 aa  348  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  66.93 
 
 		 271 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  69.08 
 
 		 266 aa  332  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  68.02 
 
 		 282 aa  314  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  55.24 
 
 		 267 aa  278  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  53.82 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  53.3 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  50.41 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  47.06 
 
 		 263 aa  225  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  45.8 
 
 		 272 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  44.02 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  41.39 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  41.39 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  40.64 
 
 		 256 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  41.25 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  44.4 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  38.84 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  41.11 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  44.68 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  44.75 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  40.17 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  39.75 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  38.21 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  40.43 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  41.08 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  39.24 
 
 		 279 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  39.21 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  38.56 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  38.56 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  39.73 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  39.74 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  38.6 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  39.82 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  35.86 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  39.3 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  38.46 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  38.26 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  37.72 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  40.17 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  38.36 
 
 		 245 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  34.21 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  34.16 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  34.65 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  35.17 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  35.83 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  37.61 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  37.76 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  38.79 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  36.48 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  36.64 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  36.64 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  36.6 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  35.17 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  31.3 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  31.02 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  27.08 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  22.83 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  28.48 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  24.89 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  28.94 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.38 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  30.07 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  30.49 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  25.6 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  26.79 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  32.69 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  27.97 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  26.49 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  28.95 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  27.97 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  27.63 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  26.57 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  31.74 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  32.5 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  26.47 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  25.83 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  31.71 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  25.17 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  25.87 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  25.87 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  26.39 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  27.75 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  28.32 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  31.41 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  25.6 
 
 		 273 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>