83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04581 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
261 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  71.48 
 
 
265 aa  362  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  57.2 
 
 
267 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  56.97 
 
 
265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  56.67 
 
 
249 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  56.33 
 
 
290 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  55.98 
 
 
266 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  56.79 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  53.82 
 
 
265 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  54.37 
 
 
282 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  55.51 
 
 
271 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  52.38 
 
 
260 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  47.18 
 
 
272 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  48.19 
 
 
263 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  48.36 
 
 
271 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  46.36 
 
 
271 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  41.74 
 
 
265 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  41.74 
 
 
265 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  46.26 
 
 
237 aa  188  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  46.64 
 
 
272 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  46.89 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  40.82 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  41.56 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  46.64 
 
 
272 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  42.11 
 
 
250 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  43.8 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  42.62 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  46.9 
 
 
254 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  43.5 
 
 
272 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  38.19 
 
 
257 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  42.21 
 
 
279 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  46.02 
 
 
245 aa  174  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  46.12 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  38.4 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  43.46 
 
 
243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  44.54 
 
 
245 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  39.24 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  44.04 
 
 
222 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  41.59 
 
 
257 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  41.56 
 
 
256 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  41.05 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  42.98 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  37.61 
 
 
239 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  42.67 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  44.31 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  43.81 
 
 
243 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 
254 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  39.92 
 
 
254 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  42.73 
 
 
276 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  40.89 
 
 
274 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  42.04 
 
 
245 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  39.15 
 
 
279 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  42.04 
 
 
245 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  41.7 
 
 
246 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  38.59 
 
 
257 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  39.39 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  38.14 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 
266 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  32.64 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  30.3 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  29.29 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  31.4 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  25.82 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  25.35 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  32.02 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  34.46 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  30.43 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  26.54 
 
 
271 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  28.22 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  26.35 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  31.97 
 
 
271 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  29.53 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  27.04 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  29.41 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  26.25 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  30.67 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  27.45 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  29.7 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 
271 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  33.1 
 
 
271 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>