71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2277 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  62.87 
 
 		 245 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  62.81 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  62.81 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  55.7 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  55.65 
 
 		 245 aa  251  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  48.21 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  47.76 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  48.36 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  47.35 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  46.47 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  45.19 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  47.54 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  45.68 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  45.68 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  45.68 
 
 		 257 aa  187  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  42.29 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  48.02 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  44.9 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  42.56 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  47.98 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  43.27 
 
 		 276 aa  168  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  40.96 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  44.07 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  41.7 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  45.02 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  42.92 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  39.68 
 
 		 272 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  43.57 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  43.2 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  36.84 
 
 		 264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  38.86 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  34.84 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  43.04 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  34.84 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  39.84 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  39.84 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  39.09 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  38.2 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  37.77 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  36.73 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  37.97 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  39.06 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  36.21 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  36.02 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  34.98 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  36.94 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  36.21 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  32.93 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  31.49 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  35.37 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  31.93 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  32.38 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  32.31 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  29.69 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  30.38 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  27.14 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  28.86 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  28.91 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  28.91 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  26.64 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  29.11 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  28.23 
 
 		 298 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>