78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3232 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  56.88 
 
 
274 aa  327  9e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  52.96 
 
 
257 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  52.57 
 
 
257 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  58.68 
 
 
250 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  58.61 
 
 
250 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  53.23 
 
 
257 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  53.54 
 
 
254 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  49.04 
 
 
279 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  45.63 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  46.48 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  47.66 
 
 
267 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  47.67 
 
 
264 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  45.32 
 
 
272 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  46.33 
 
 
269 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  45.31 
 
 
272 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  46.98 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  46.64 
 
 
249 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  45.42 
 
 
245 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  45.15 
 
 
245 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  40.87 
 
 
263 aa  168  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  40.64 
 
 
271 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 
267 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  43.27 
 
 
246 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  37.4 
 
 
272 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  42.73 
 
 
261 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  38.4 
 
 
265 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  38.4 
 
 
265 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  40.89 
 
 
265 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  43.88 
 
 
245 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  43.88 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  40.85 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  38.52 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  37.8 
 
 
290 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  35.66 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  36.08 
 
 
279 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  40.26 
 
 
243 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  39.82 
 
 
271 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  37.55 
 
 
254 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  40.69 
 
 
240 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 
254 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  34.9 
 
 
271 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 
236 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  41.2 
 
 
266 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  36.84 
 
 
249 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
260 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  35.83 
 
 
265 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  37.9 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  36.73 
 
 
282 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  34.26 
 
 
255 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  32.92 
 
 
257 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  34.06 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  34.4 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  34.73 
 
 
256 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  33.48 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  33.94 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  36.41 
 
 
234 aa  95.9  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  31.28 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  30.13 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  26.03 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  26.03 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  27.35 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  27.35 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  33 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.35 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  27.35 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  29.17 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  26.25 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  29.82 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  26.87 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  26.21 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>