64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3849 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  56.9 
 
 
235 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  53.88 
 
 
289 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  52.19 
 
 
234 aa  241  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  40.79 
 
 
247 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  44.02 
 
 
247 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  46.64 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  31.7 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  31.7 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  29.71 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  32.81 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  34.23 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  29.91 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  34.65 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  30.13 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  30.37 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  30.37 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  30.73 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  32.64 
 
 
261 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  35.91 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  32.24 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  30.9 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  28.96 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  31.48 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  33.52 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  26.69 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  29.07 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  32.28 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  33.51 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  32.11 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  34.48 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  31.95 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  31.12 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  31.41 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  27.31 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  30.89 
 
 
264 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  26.67 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  28.82 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  29.79 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  25.85 
 
 
279 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  26.75 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  30.54 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  30.89 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  29.73 
 
 
282 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  28.99 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  31.76 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  27.69 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  28.4 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  29.36 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  30.95 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  27.12 
 
 
265 aa  48.9  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  27.68 
 
 
240 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  27.01 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  29.76 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>