68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2132 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  58.8 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  58 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  55.36 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  47.98 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  47.98 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  46.94 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  51.06 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  50.21 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  47.86 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  42.68 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  43.7 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  43.7 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  43.44 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  42.21 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  41.25 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  38.19 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  38.89 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  39.84 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  40.16 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  40.82 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  38.59 
 
 		 272 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  38.21 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  36.21 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  40.18 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 266 aa  155  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  36.29 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  41.56 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  36.55 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  37.3 
 
 		 282 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  38.89 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  40.95 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  38.03 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  37.82 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  37.08 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 		 245 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  40.17 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  34.89 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  35.1 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  35.96 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  37.44 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  34.23 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  35 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  34.42 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  34.06 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  33.92 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  34.78 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  34.15 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  36.21 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  34.5 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  33.6 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  31.7 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  30.43 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  32.4 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  36.02 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  32.4 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  31.09 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  31.61 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  32.81 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  27.66 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  33 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  31.25 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  29.14 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  28.75 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>