72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2485 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  93.88 
 
 		 245 aa  420  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  93.47 
 
 		 245 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  65.25 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  60.5 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  62.87 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  49.38 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  52.59 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  52.61 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  51.52 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  44.72 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  50.22 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  48.77 
 
 		 265 aa  204  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  51.29 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  49.19 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  45.8 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  48.03 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  50.22 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  46.28 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  46.96 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  44.49 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  44.81 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  44.54 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  45.27 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  42.17 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  43.62 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  46.19 
 
 		 290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  44.02 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  40.17 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  41.18 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  40.17 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  42.98 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  42.98 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  41.3 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  43.22 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  39.22 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  40.74 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  41.05 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  38.91 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  35.83 
 
 		 237 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  37.45 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  36.95 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  38.75 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  36.14 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  36.97 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  36.97 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  34.4 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  34.25 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  34.96 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  35.4 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  33.61 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  33.87 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  32.77 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  34.31 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  32.82 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  31.19 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  30.05 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  23.66 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  23.12 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  31.37 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  30.19 
 
 		 300 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  29.41 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  35.29 
 
 		 273 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>