66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2748 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
257 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  99.22 
 
 
257 aa  507  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  90.27 
 
 
257 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  69.57 
 
 
254 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  65.84 
 
 
250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  64.2 
 
 
250 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  52.57 
 
 
276 aa  261  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  55.56 
 
 
274 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  50.97 
 
 
279 aa  250  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  49.18 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  51.27 
 
 
272 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  49.39 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  48.15 
 
 
269 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  49.58 
 
 
272 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  50.85 
 
 
264 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  48.15 
 
 
265 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  48.66 
 
 
243 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  49.79 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  52.17 
 
 
245 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  51.3 
 
 
245 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  51.3 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  45.78 
 
 
245 aa  188  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 
263 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  45.68 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  42.32 
 
 
272 aa  181  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  43.75 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  40.42 
 
 
267 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  42.55 
 
 
290 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  41.39 
 
 
265 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.3 
 
 
264 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  45.13 
 
 
265 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  39.13 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  39.13 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  44 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  42.22 
 
 
266 aa  162  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
265 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  40.18 
 
 
249 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  39.83 
 
 
267 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
243 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  42.67 
 
 
282 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  39.73 
 
 
260 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  39.21 
 
 
236 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  40.18 
 
 
254 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  40.18 
 
 
254 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  38.39 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  36.51 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  37.08 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  34.5 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  35.06 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  37.18 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  37.39 
 
 
256 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  35.91 
 
 
250 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  35.56 
 
 
222 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  34.48 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  36.51 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  34.65 
 
 
246 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  31.96 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  31.22 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  26.56 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  26.56 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  31.95 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  28.8 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>