82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3383 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
265 aa  523  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  56.97 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  57.2 
 
 
265 aa  265  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  54.55 
 
 
260 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  52.63 
 
 
267 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  52.26 
 
 
267 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  52.97 
 
 
290 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  52.07 
 
 
271 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  52.59 
 
 
237 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  50.41 
 
 
265 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  51.75 
 
 
249 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  51.82 
 
 
266 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  48.97 
 
 
263 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  49.18 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  51.67 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  46.12 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 
272 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  48.95 
 
 
250 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  45.61 
 
 
272 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  43.1 
 
 
279 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  44.74 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  39.26 
 
 
265 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  45.13 
 
 
257 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  39.26 
 
 
265 aa  168  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  45.13 
 
 
257 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  47.52 
 
 
250 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  44.58 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  42.17 
 
 
254 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  42.17 
 
 
254 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  45.13 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  42.04 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  37.86 
 
 
255 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  38.72 
 
 
264 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  36.84 
 
 
256 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  36.44 
 
 
256 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  44.84 
 
 
240 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  41.52 
 
 
265 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  39.67 
 
 
279 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  39.73 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  42.68 
 
 
245 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  44.44 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  43.57 
 
 
246 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  39.75 
 
 
249 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  36.55 
 
 
257 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  38.94 
 
 
264 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  40.34 
 
 
250 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  40.85 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  36.86 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  40.44 
 
 
257 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  39.15 
 
 
245 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  42.34 
 
 
236 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  42.68 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  37.71 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  38.5 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  42.68 
 
 
245 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  40.45 
 
 
222 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  38.02 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  32.05 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  28.82 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  31.77 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  31.37 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  28.86 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  22.79 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  23.26 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  28.19 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  31.03 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  28.78 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  29.66 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  31.08 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  28.85 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  28.86 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  32.35 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  33.58 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  30.72 
 
 
273 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  26.14 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  30.6 
 
 
267 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  31.85 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  30.99 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  28.06 
 
 
266 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  26.58 
 
 
285 aa  42  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>