68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3692 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  72.14 
 
 		 269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  68.7 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  70.21 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  57.03 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  56.47 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  57.42 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  58.53 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  54.09 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  50.57 
 
 		 279 aa  261  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  51.45 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  49.18 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  49.18 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  47.66 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  50.83 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  49.37 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  50.21 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  49.79 
 
 		 249 aa  215  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  45.8 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  45.8 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  45.19 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  44.05 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  45.38 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  45.38 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  38.21 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  44.93 
 
 		 236 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  41.53 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  42.67 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  35.89 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  43.11 
 
 		 240 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  37.22 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  37.22 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  37.13 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  38.18 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  36.86 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  38.18 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  37.07 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  35.78 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  38.6 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  34.65 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  37.13 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  34.5 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  34.58 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  36.44 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  34.89 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  37.02 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  32.74 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  34.91 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  32.3 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  33.92 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  33.92 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  30.64 
 
 		 239 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  31.67 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  31.62 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  33.48 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  28.71 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  31.16 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  28.28 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  27.2 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  27.18 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  23.81 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  28.4 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  23.38 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  27.03 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  30.41 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>