74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1767 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
245 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  99.59 
 
 
245 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  93.47 
 
 
245 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  62.98 
 
 
245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  59.23 
 
 
249 aa  280  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  62.81 
 
 
246 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  48.97 
 
 
254 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  51.72 
 
 
257 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  51.74 
 
 
257 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  49.79 
 
 
250 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  50.22 
 
 
272 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  47.93 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  45.38 
 
 
267 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  44.31 
 
 
269 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  46.96 
 
 
265 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  47.72 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  47.56 
 
 
279 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  50.22 
 
 
272 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  46.72 
 
 
272 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  44.67 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  47.39 
 
 
274 aa  188  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  43.15 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  42.04 
 
 
261 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  44.03 
 
 
276 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  40.91 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  45 
 
 
290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  40.56 
 
 
267 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  42.98 
 
 
240 aa  158  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  43.51 
 
 
265 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  41.56 
 
 
271 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  41.03 
 
 
271 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  38.4 
 
 
263 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  40.17 
 
 
265 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  40.17 
 
 
265 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.02 
 
 
264 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  40.76 
 
 
266 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  41.35 
 
 
267 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  40.6 
 
 
249 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  41.6 
 
 
282 aa  138  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  39.32 
 
 
236 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 
265 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 
243 aa  131  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  37.71 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 
237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  39.3 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  37.23 
 
 
257 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  39.17 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  35.74 
 
 
256 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  37.24 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  37.24 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  35.32 
 
 
256 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  35.84 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  32.8 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  34.42 
 
 
255 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  35.68 
 
 
222 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  34.3 
 
 
250 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  31.78 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  34.55 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  30.86 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 
289 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  29.63 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  30.2 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  23.66 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  29.26 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  23.66 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  31.36 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  31.34 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  34.78 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  25.7 
 
 
292 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 
300 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  28.06 
 
 
267 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>