110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2443 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
266 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  84.4 
 
 
282 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  73.97 
 
 
271 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  70.16 
 
 
290 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  69.08 
 
 
265 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  69.51 
 
 
249 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  68.31 
 
 
267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  56.85 
 
 
267 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  55.98 
 
 
261 aa  272  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  52.36 
 
 
265 aa  257  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  56.15 
 
 
260 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  51.76 
 
 
263 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  51.82 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  49.4 
 
 
272 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  47.52 
 
 
271 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  45.82 
 
 
271 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  46.15 
 
 
239 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  42.15 
 
 
265 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  42.15 
 
 
265 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  45.81 
 
 
237 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  42.98 
 
 
256 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  42.11 
 
 
250 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 
264 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  42.37 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  42.67 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  42.22 
 
 
257 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  39.57 
 
 
255 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  44.75 
 
 
222 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  42.74 
 
 
279 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  40.7 
 
 
254 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  41.87 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  41.87 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  44.89 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  41.78 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  38.71 
 
 
279 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  40.17 
 
 
269 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  42.67 
 
 
245 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  40.91 
 
 
272 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  41.67 
 
 
272 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  41.48 
 
 
265 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  38.33 
 
 
267 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 
245 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  41.67 
 
 
272 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  39.47 
 
 
264 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  39.91 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  41.53 
 
 
236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  39.73 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  38.71 
 
 
266 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  42.17 
 
 
250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  37.44 
 
 
274 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  41.13 
 
 
243 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  41.2 
 
 
276 aa  141  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  40.09 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  39.75 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  39.22 
 
 
240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  40.25 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  40.25 
 
 
245 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  39.06 
 
 
246 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 
289 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.82 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  26.25 
 
 
271 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  30.97 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  31.76 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  29.13 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  29.13 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  26.88 
 
 
271 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  31.94 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  28.39 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  30.46 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  27.22 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  28.48 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  26.87 
 
 
340 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  27.33 
 
 
265 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  27.33 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  27.33 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  30.61 
 
 
266 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  25.81 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.08 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  26.56 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  26.71 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  26.71 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  27.45 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  26.07 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  30.51 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  26.35 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  26.09 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  25.56 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  28.05 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  25.66 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  29.14 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  28.47 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  27.33 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  26.19 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  26.92 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  26.22 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>