More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1686 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1686  pseudouridine synthase  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0958  pseudouridine synthase  48.85 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0787  pseudouridine synthase  40.15 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3153  pseudouridine synthase  44.07 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.79077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2728  pseudouridine synthase  41.92 
 
 		 305 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1515  pseudouridine synthase  46 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2547  pseudouridine synthase  43.98 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1708  pseudouridine synthase  39.24 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.104417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3679  RNA pseudouridine synthase family protein  37.59 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  31.58 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1802  RluA family pseudouridine synthase  39.74 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.72 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0824  RluA family pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002394  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0988  pseudouridine synthase  30.13 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0791  pseudouridine synthase  37.5 
 
 		 204 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00896147  normal  0.0723816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2087  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.21 
 
 		 245 aa  95.5  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000349962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.11 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.52 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  34.25 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2094  pseudouridine synthase, RluD  32.4 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0919  RluA family pseudouridine synthase  37.7 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.976861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  27.7 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1933  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 222 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.640885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.86 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02470  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 		 520 aa  89  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0281406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0375  RluA family pseudouridine synthase  29.38 
 
 		 299 aa  89  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000429003  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  35.62 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2089  pseudouridylate synthase family protein, yabo  30.27 
 
 		 298 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  34.87 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5191  pseudouridine synthase, RluA family  34.94 
 
 		 308 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000721787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0568  pseudouridine synthase  36.51 
 
 		 217 aa  89  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0777  pseudouridine synthase, RluA family  35.58 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1736  pseudouridine synthase  35.83 
 
 		 222 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  37.42 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2377  RluA family pseudouridine synthase  30.15 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1196  pseudouridine synthase, RluA family  29.68 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.69 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2896  pseudouridine synthase  34.03 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.76004  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3457  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  36.63 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3139  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.65 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.65 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000100067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1096  pseudouridylate synthase  32.82 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3831  pseudouridylate synthase  34.2 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1386  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.32 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.019865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4520  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.14 
 
 		 227 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1506  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.88 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0155  pseudouridine synthase  34.88 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  30.84 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1938  pseudouridine synthase  27.03 
 
 		 273 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.153319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1904  pseudouridine synthase  27.03 
 
 		 273 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.014884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1202  pseudouridine synthase  29.65 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.0231079 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.39 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2909  pseudouridine synthase  33.65 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  38.12 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  29.21 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  34.39 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  32.5 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0680  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  34.59 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  32 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0175  pseudouridine synthase, RluA family  32.1 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2914  pseudouridine synthase  33.8 
 
 		 551 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1435  RNA pseudouridine synthase family protein  36.36 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2180  pseudouridine synthase, RluA family  39.62 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2148  pseudouridine synthase  30.97 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2886  pseudouridine synthase  32.81 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1430  pseudouridine synthase  34.38 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2529  pseudouridine synthase  38.67 
 
 		 578 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  31.48 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  36.05 
 
 		 578 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0834  pseudouridylate synthase  33.18 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  33.85 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  29.49 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2615  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.38 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0357699  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  29.49 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0056  pseudouridine synthase  33.74 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.17 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1931  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  36.67 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.176665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  35.08 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0799  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.7 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.603428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4154  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  36.13 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1442  pseudouridylate synthase  32.81 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81175  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  34.93 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1566  pseudouridine synthase  32.29 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232461  hitchhiker  0.00000912019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6830  pseudouridine synthase, RluA family  30 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3182  pseudouridine synthase  36.84 
 
 		 551 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186572  normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  31.1 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  28.52 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2314  pseudouridine synthase, RluD  34.02 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.651442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  33.77 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3827  pseudouridine synthase  34.92 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2811  pseudouridine synthase  32.29 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0225697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  29.41 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2401  pseudouridine synthase, RluA family  36.84 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2791  pseudouridine synthase  32.29 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1675  pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2524  pseudouridylate synthase  31.11 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349394  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0713  tRNA pseudouridine synthase C  30.1 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  29.33 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09301  putative pseudouridylate synthase  34.86 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>