More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0300 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  510  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2247  hypothetical protein  55.98 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  52.79 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1441  mechanosensitive ion channel  49.38 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  49.36 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  28.49 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  35.64 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.13 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.13 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.13 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.13 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.13 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.13 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.13 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  37.62 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.13 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  29.25 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 		 1235 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  31.79 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  32.35 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  41.41 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  30.3 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  32.43 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.27 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 429 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.27 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.27 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0408  hypothetical protein  31.07 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.75 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  30.63 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  25.95 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0457  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.33 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1139  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  40.58 
 
 		 324 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  32.38 
 
 		 408 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0752  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  38.24 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 1166 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 173 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 785 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0246  hypothetical protein  28.35 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.19 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  28.15 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5651  hypothetical protein  31.96 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0457  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  28.83 
 
 		 891 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>