54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2984 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  583  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  53.59 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  52.61 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  34.54 
 
 		 228 aa  99.4  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  30.05 
 
 		 229 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  30.54 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  36.29 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  27.84 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  28.14 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  28.74 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  30.6 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  26.58 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  25.84 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  24.55 
 
 		 499 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0558  TM helix repeat-containing protein  26.49 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  24.31 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1441  mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0737  TM helix repeat-containing protein  28.48 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal  0.444649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  23.58 
 
 		 547 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  24.74 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  23.92 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  25.16 
 
 		 487 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  25.16 
 
 		 487 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  24.52 
 
 		 487 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  24.52 
 
 		 487 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  26.47 
 
 		 487 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  24.04 
 
 		 487 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  21.93 
 
 		 543 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  24.52 
 
 		 487 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  26.47 
 
 		 503 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  26.47 
 
 		 503 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  26.47 
 
 		 503 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  26.47 
 
 		 503 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  26.47 
 
 		 487 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  26.47 
 
 		 487 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  24.02 
 
 		 486 aa  49.3  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  26.47 
 
 		 487 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  25.44 
 
 		 494 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  24.39 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  23.48 
 
 		 565 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  23.48 
 
 		 582 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  24.64 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  21.05 
 
 		 543 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1346  hypothetical protein  30.51 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.161879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1736  TM helix repeat-containing protein  28.44 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  23.33 
 
 		 525 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  22.22 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  18.06 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  23.08 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0005  Conserved TM helix repeat-containing protein  26.99 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2247  hypothetical protein  24.81 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208343 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0752  TM helix repeat-containing protein  26.61 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  22.73 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>