23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0220 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  36.04 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  33.18 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  32.13 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1346  hypothetical protein  31.49 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.161879 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  26.52 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  30.84 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  27.47 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  25.22 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  27.83 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  27.83 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  27.83 
 
 		 487 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  27.83 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  27.83 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  27.83 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  27.39 
 
 		 487 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  30.43 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  28.7 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  23.76 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  22.5 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  25.35 
 
 		 487 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  29.95 
 
 		 494 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  21.6 
 
 		 227 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>