16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0558 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0558  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 281 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0737  TM helix repeat-containing protein  79.57 
 
 		 279 aa  441  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal  0.444649 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1736  TM helix repeat-containing protein  80 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0752  TM helix repeat-containing protein  79.64 
 
 		 279 aa  430  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0005  Conserved TM helix repeat-containing protein  32.75 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0481  TM helix repeat-containing protein  33.07 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.087662  hitchhiker  0.00285155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1227  TM helix repeat-containing protein  31.55 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  29.55 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  25.65 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  26.49 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  28.83 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  25.49 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  26.35 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  26.35 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  26.35 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  23.53 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>