30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0334 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 228 aa  441  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  76.75 
 
 		 228 aa  353  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  72.37 
 
 		 229 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  43.72 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  31.8 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  31.66 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  30.54 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  30.84 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  29.51 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  28.51 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  25.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1361  hypothetical protein  26.54 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  28.72 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  24.75 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0275  hypothetical protein  30.23 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  27.62 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0596  hypothetical protein  29.47 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0005  Conserved TM helix repeat-containing protein  22.88 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152576  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  26.05 
 
 		 257 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  27.33 
 
 		 499 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  26.89 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  28.44 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  26.89 
 
 		 335 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1341  hypothetical protein  29.13 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.306672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1346  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.161879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  26.89 
 
 		 335 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  27.91 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  24.03 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0558  TM helix repeat-containing protein  23.53 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  25.83 
 
 		 487 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>