10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1361 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0275  hypothetical protein  68.69 
 
 		 197 aa  219  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0596  hypothetical protein  62.12 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1341  hypothetical protein  69.7 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.306672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  25.79 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  25.62 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  24.39 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  27.95 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  28.49 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  26.82 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>