35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1056 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 229 aa  449  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  72.37 
 
 		 228 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  66.52 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  44.39 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  29.58 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  29.52 
 
 		 271 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  31.41 
 
 		 306 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  26.52 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  26.86 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  23.83 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  29.83 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0558  TM helix repeat-containing protein  25.65 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  25 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0005  Conserved TM helix repeat-containing protein  25.57 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  26.21 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1361  hypothetical protein  25.9 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  28.46 
 
 		 499 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1736  TM helix repeat-containing protein  27.93 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0752  TM helix repeat-containing protein  29.73 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  26.89 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  26.89 
 
 		 335 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  26.89 
 
 		 335 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0275  hypothetical protein  29.46 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0737  TM helix repeat-containing protein  24.24 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal  0.444649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  25.23 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  26.83 
 
 		 287 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1346  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.161879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  27.64 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  22.77 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  24.69 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  23.13 
 
 		 487 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  27.87 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  22.79 
 
 		 582 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  25.73 
 
 		 274 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>