55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2091 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1145    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  95.01 
 
 		 565 aa  1055    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  72.29 
 
 		 525 aa  748    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  41.44 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  42.25 
 
 		 487 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  42.46 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  42.46 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  42.25 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  42.46 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  42.25 
 
 		 487 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  39.92 
 
 		 487 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  39.92 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  39.92 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  39.92 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  39.92 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  41.4 
 
 		 487 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  39.92 
 
 		 487 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  39.92 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  39.79 
 
 		 487 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  41.19 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  38 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  34.07 
 
 		 499 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  31.36 
 
 		 543 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  31.36 
 
 		 543 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  31.35 
 
 		 547 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  28.04 
 
 		 255 aa  72  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  31.29 
 
 		 275 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  27.89 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  29.79 
 
 		 279 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  29.37 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  28.04 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  21.56 
 
 		 223 aa  57  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  23.18 
 
 		 227 aa  55.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  30.77 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  30.77 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  30.77 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  23.91 
 
 		 235 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  24.38 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  29.53 
 
 		 239 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  26.77 
 
 		 275 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3531  hypothetical protein  31.72 
 
 		 276 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41590  putative cytoplasmic membrane protein  31.72 
 
 		 274 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  29.79 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  28.57 
 
 		 287 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  28.57 
 
 		 287 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  23.16 
 
 		 236 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  29.71 
 
 		 272 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  28.33 
 
 		 274 aa  47  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  22.6 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  24.24 
 
 		 228 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  26.29 
 
 		 271 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  25.42 
 
 		 229 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  22.87 
 
 		 257 aa  45.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  26.21 
 
 		 239 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  28.49 
 
 		 265 aa  44.3  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>