73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1406 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  53.39 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  34.39 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  32.56 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  34.98 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  28.64 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  27.98 
 
 		 275 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3531  hypothetical protein  33.16 
 
 		 276 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41590  putative cytoplasmic membrane protein  33.16 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1775  TM helix protein  33.18 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  33.33 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1605  TM helix repeat-containing protein  32.23 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00681338  decreased coverage  0.000000000154997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  31.51 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2087  TM helix repeat-containing protein  32.23 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245727  normal  0.0375248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3653  TM helix repeat-containing protein  32.23 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0445182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  27.68 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2090  TM helix repeat-containing protein  32.23 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00247017  normal  0.258692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2095  TM helix protein  32.7 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0461104  hitchhiker  0.00386478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2297  hypothetical protein  32.23 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000644862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1598  TM helix repeat-containing protein  31.75 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0082628  hitchhiker  0.00441813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  30.5 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  30.5 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  29.79 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  29.08 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  26.32 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  30.81 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  24.87 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  27.27 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  25.86 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  25.24 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  26.42 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  28.28 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  30.77 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  26.42 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  29.81 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  25.53 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  25.47 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  22.48 
 
 		 565 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  21.56 
 
 		 582 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  28.77 
 
 		 543 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  28.08 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  25.28 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  21.68 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  25.28 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  25.28 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  31.69 
 
 		 487 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3200  hypothetical protein  26.98 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.384687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  23.7 
 
 		 487 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  24.18 
 
 		 547 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  22.75 
 
 		 487 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  29.58 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  22.75 
 
 		 487 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  21.36 
 
 		 525 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  24.32 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  22.27 
 
 		 487 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  28.24 
 
 		 486 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  27.51 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  22.27 
 
 		 487 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  22.27 
 
 		 487 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  22.27 
 
 		 487 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  26.8 
 
 		 487 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  26.95 
 
 		 306 aa  48.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  24.84 
 
 		 503 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  24.84 
 
 		 503 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  24.84 
 
 		 487 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  25.4 
 
 		 271 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  24.84 
 
 		 487 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  24.84 
 
 		 503 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  24.84 
 
 		 503 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  24.84 
 
 		 487 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  22.77 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  23.92 
 
 		 306 aa  45.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  24.03 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>