14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1736 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1736  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 279 aa  536  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0752  TM helix repeat-containing protein  96.77 
 
 		 279 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0737  TM helix repeat-containing protein  84.59 
 
 		 279 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal  0.444649 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0558  TM helix repeat-containing protein  80 
 
 		 281 aa  441  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0005  Conserved TM helix repeat-containing protein  29.89 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0481  TM helix repeat-containing protein  36.82 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.087662  hitchhiker  0.00285155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1227  TM helix repeat-containing protein  30.11 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  26.85 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  25.93 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  25.45 
 
 		 335 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  25.45 
 
 		 335 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  25.45 
 
 		 335 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  24.81 
 
 		 228 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  23.53 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>