51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1787 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  98.81 
 
 		 335 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 335 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  100 
 
 		 335 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  57.71 
 
 		 257 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  64.68 
 
 		 287 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  62.84 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  58.8 
 
 		 275 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  55.25 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  44.66 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  51.43 
 
 		 272 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  40.93 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  33.22 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  35.25 
 
 		 460 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  26.53 
 
 		 223 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  31.07 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  27.46 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  30.77 
 
 		 582 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  31.32 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  25.68 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  27.51 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  24.32 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  25 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  30.32 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  27.01 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  28 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  27.27 
 
 		 229 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0737  TM helix repeat-containing protein  26.76 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal  0.444649 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  25.56 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  30.81 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  33.04 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0558  TM helix repeat-containing protein  26.35 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1736  TM helix repeat-containing protein  27.46 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  25.14 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  28.57 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0752  TM helix repeat-containing protein  26.76 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2632  TM helix repeat-containing protein  28.5 
 
 		 273 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.225391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  24.85 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  26.73 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  26.01 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  22.22 
 
 		 543 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  30.95 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  22.31 
 
 		 547 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  22.22 
 
 		 543 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  34.19 
 
 		 229 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1605  TM helix repeat-containing protein  33.93 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00681338  decreased coverage  0.000000000154997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1775  TM helix protein  33.93 
 
 		 274 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2087  TM helix repeat-containing protein  33.93 
 
 		 274 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245727  normal  0.0375248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3653  TM helix repeat-containing protein  33.93 
 
 		 274 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0445182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  25.64 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1598  TM helix repeat-containing protein  33.93 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0082628  hitchhiker  0.00441813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>