More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0505 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 254 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  85.83 
 
 		 255 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  48.99 
 
 		 260 aa  244  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1441  mechanosensitive ion channel  52.52 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2247  hypothetical protein  47.1 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  31.97 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  28 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  28.05 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 533 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  30.53 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  23.26 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  29.68 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.14 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 359 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 336 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  24.88 
 
 		 1080 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.76 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.76 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  31.43 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 809 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 1068 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  31.19 
 
 		 1134 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  26.45 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  30.28 
 
 		 1134 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1072 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1072 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  22.99 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 1166 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  33.68 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1072 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 360 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 429 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  24.84 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  28.57 
 
 		 1067 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  33.04 
 
 		 1133 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.97 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1067 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  25.35 
 
 		 1078 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 547 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1067 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  31.19 
 
 		 1117 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>