More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2247 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2247  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  511  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  55.98 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  51.07 
 
 		 255 aa  231  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1441  mechanosensitive ion channel  51.25 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  48.5 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  33.54 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  33.54 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  32.91 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  32.91 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  32.91 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  32.91 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  32.91 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  32.91 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  32.91 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  32.91 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  32.91 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.01 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.01 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 421 aa  65.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  34.4 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  34.4 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  34.4 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  34.4 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  34.4 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  34.68 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0408  hypothetical protein  29.41 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  33.62 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  30.46 
 
 		 284 aa  62  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  31.65 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0457  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  32.28 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  31.65 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  27.95 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  39.18 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  28.16 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  36.11 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 		 414 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  29.94 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  30.16 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.41 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.1 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  31.48 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0246  hypothetical protein  28.21 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  26.88 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  28.29 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>