More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1441 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1441  mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 262 aa  501  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  55.98 
 
 		 255 aa  272  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  52.56 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  49.58 
 
 		 260 aa  245  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2247  hypothetical protein  51.25 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  38.67 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  35.51 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  33.11 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  33.11 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.67 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  33.11 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  33.11 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  29.48 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  36.45 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  36.79 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  34.32 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.79 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.79 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  36.29 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  36.29 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  36.29 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  36.29 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  40.62 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  32.65 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  30.97 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  32.65 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  32.65 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  32.65 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  32.65 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  32.65 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  36.29 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 		 277 aa  62  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  32.65 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  34.19 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.85 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  37.76 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  27.44 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.92 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  33.54 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 550 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  34.68 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  28.97 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  31.72 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  27.81 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>