42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0269 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  100 
 
 		 306 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  81.05 
 
 		 306 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  53.59 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  28.89 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  31.43 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  26.86 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  29.51 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  29.59 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  24.14 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  28.65 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  25.53 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  28.28 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  22.88 
 
 		 543 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  24.01 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  22.46 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  25.85 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  22.45 
 
 		 499 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  26.32 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  22.7 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  23.03 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  23.03 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  22.7 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  23.03 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  28.03 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  25 
 
 		 565 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  24.9 
 
 		 582 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  22.04 
 
 		 487 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0558  TM helix repeat-containing protein  26.71 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  27.03 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  27.03 
 
 		 487 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  27.03 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  27.03 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  27.03 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  22.37 
 
 		 487 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  27.03 
 
 		 487 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  27.03 
 
 		 487 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  24.64 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  24.81 
 
 		 230 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1736  TM helix repeat-containing protein  30.28 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  23.65 
 
 		 547 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  26.35 
 
 		 487 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  20.14 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>