60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5911 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 279 aa  554  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  44.57 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  45.99 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  47.79 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  47.79 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  47.79 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  43.17 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  44.09 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  44.4 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  38.52 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  39.49 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  32.17 
 
 		 358 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  31.13 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  31.34 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  34.8 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  29.17 
 
 		 543 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  29.37 
 
 		 543 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  23.67 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  25.54 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  29.79 
 
 		 582 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  27.27 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  26.06 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  30.28 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  24.14 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  28.67 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  23.59 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  27.69 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  27.57 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  30.47 
 
 		 487 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  27.89 
 
 		 487 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  31.01 
 
 		 487 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  27.89 
 
 		 487 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  27.89 
 
 		 487 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  27.89 
 
 		 503 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  27.89 
 
 		 503 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  27.89 
 
 		 503 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  27.89 
 
 		 503 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  22.99 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  22.73 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3531  hypothetical protein  32.46 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41590  putative cytoplasmic membrane protein  32.46 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  27.21 
 
 		 487 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  27.33 
 
 		 487 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  30.53 
 
 		 487 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  30.15 
 
 		 486 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  30.53 
 
 		 487 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  30.53 
 
 		 487 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  26.32 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  26.21 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  27.33 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  22.54 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  23.72 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  30.53 
 
 		 487 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  30.53 
 
 		 487 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  20.9 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  25.38 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2090  TM helix repeat-containing protein  31.25 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00247017  normal  0.258692 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  25.38 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  23.12 
 
 		 221 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>