42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0146 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  99.79 
 
 
487 aa  934    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  84.39 
 
 
487 aa  809    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  84.39 
 
 
487 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  84.39 
 
 
487 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  99.79 
 
 
503 aa  933    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  99.79 
 
 
503 aa  933    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  84.39 
 
 
487 aa  810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  936    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  936    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  99.79 
 
 
487 aa  934    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  83.78 
 
 
487 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  97.95 
 
 
487 aa  904    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  84.39 
 
 
487 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  84.6 
 
 
487 aa  812    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  84.39 
 
 
487 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  58.44 
 
 
486 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  54.18 
 
 
494 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  40.5 
 
 
525 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  40.26 
 
 
565 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  40.31 
 
 
582 aa  365  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  37.83 
 
 
499 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  34.69 
 
 
543 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  34.5 
 
 
543 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  35.13 
 
 
547 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  25.11 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  27.52 
 
 
230 aa  67  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  26.19 
 
 
276 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  25.45 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  30.57 
 
 
274 aa  53.5  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  27.78 
 
 
239 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  27.89 
 
 
279 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  26.8 
 
 
255 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  27.5 
 
 
243 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  28.5 
 
 
239 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  26.9 
 
 
221 aa  47  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  27.33 
 
 
275 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  24.84 
 
 
223 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  26.89 
 
 
241 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  27.03 
 
 
306 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  35.14 
 
 
240 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  24.4 
 
 
306 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>