49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0500 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  100 
 
 		 547 aa  1061    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  49.9 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  49.71 
 
 		 543 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  38.52 
 
 		 499 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  36.69 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  36.69 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  35.69 
 
 		 487 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  36.09 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  36.49 
 
 		 487 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  36.49 
 
 		 487 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  36.29 
 
 		 487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  35.47 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  35.13 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  35.13 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  35.13 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  35.13 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  35.13 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  35.13 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  35.13 
 
 		 487 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  35.13 
 
 		 487 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  35.53 
 
 		 487 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  33.73 
 
 		 486 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  31.22 
 
 		 565 aa  243  7.999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  31.02 
 
 		 582 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  31.54 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  30.28 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  27.31 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  27.95 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  27.21 
 
 		 275 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  29.87 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  22.45 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  24.18 
 
 		 223 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  24.06 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  25.77 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  23.19 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  26.17 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2984  hypothetical protein  23.58 
 
 		 306 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.20248  normal  0.0286538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  22.48 
 
 		 276 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  29.94 
 
 		 221 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  28.39 
 
 		 236 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  28.39 
 
 		 236 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  23.35 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  28.39 
 
 		 235 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  22.55 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  27.34 
 
 		 229 aa  47.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  27.45 
 
 		 271 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  22.71 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>